@reinaldorti,
Tbm estava na mesma situação, porém é só uma mensagem de alerta e mesmo assim não conseguia exportar o banco.
Consegui resolver indo até Preferences> Administrator e no campo "Path to mysqldump Tool" coloquei o caminho do mysqldump da instalação do MySql - C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.6\bin\mysqldump.exe (no caso ver onde foi instalado o seu MySql).
resolveu o meu problema, espero que resolva o seu tbm.