Página inicial exibido todo os contéudo

Boa noite pessoal!.. Estou tendo um pequeno problema quando o meu site é acessado pelo domínio www.meusite.com.br ou www.meusite.com.br/index.php. O problema é que toda vez que ele é acessado com alguma das opções, todas as páginas que compoe o site é exibida uma embaixo da outra como se fosse uma única página. O que está causando isso eu já detectei, mas não estou sabendo como soluciono esse problema sem ter que troca a função que estou usando em todo o site, segue o código abaixo:

<?

$categoria = isset($_GET['categoria']) ? $_GET['categoria'] : ".";
$inc = file_exists($categoria.".php") ? $categoria.".php" : "inicio.php";
include_once ($inc);
$categoria = isset($_GET['categoria']) ? $_GET['categoria'] : ".";
$inc = file_exists($categoria.".php") ? $categoria.".php" : "empresa.php";
include_once ($inc);
$categoria = isset($_GET['categoria']) ? $_GET['categoria'] : ".";
$inc = file_exists($categoria.".php") ? $categoria.".php" : "politica.php";
include_once ($inc);
?>

O código utilizado está funcionando perfeitamente, o link da opção desejada defini da seguinte maneira:

<a href="index.php?categoria=inicio" class="menu" title="Principal">Principal</a>

Então o que falta é definir algo na lista que quando o site for acessado através do dominio somente a página principal seja exibida, mas só que eu não sei como fazer isso.

Desde já agradeço pela atenção.