Sincronizar BD Web com BD Desktop

Estou com uma aplicação de frente de loja rodando na Web, uma especie de comercio eletronico. E no cliente possuo uma outra aplicação que roda em Desktop fazendo também a frente de loja, neste caso na propria loja.O problema é que os dois bancos são os mesmos, porém não estão sincronizados.Pensei em guardar todas os INSERTS, DELETES e UPDATEs que forem realizados em ambos os bancos e em determinada hora do dia rodar os dois.O problema é que neste caso, se a aplicacao Web executar um DELETE sobre um registro X, e a aplicacao Desktop executar um UPDATE na mesma, quando eu for sincronizar, a aplicação irá se perder.Alguem sabe alguma solução para este tipo de problema?