Performance do mysql no linux

Prezados,Estou tendo problemas no que diz respeito ao desempenho do mysql em ambiente linux.A princípio o problema era o número de conexões simultâneas (como padrão - definido como 100). Quando as conexões chegavam a 100, o mysql bloqueava as conexões as superiores.Executei os comandos abaixo para tentar liberar mais conexões:set global max_connections = 1000set global max_connect_errors = 1000set global wait_timeout = 300Aí o problema gerado foi outro: o linux ou o próprio mysql não consegue gerenciar as conexões e acaba "travando" por alguns minutos.Já aumentamos a "potencia" dos servidores e ainda não obtivemos sucesso.Como configurar o mysql para melhorar o desempenho?Utilizo a versão 4.1.12 Standard.Desde já agradeço.