Desenvolvimento de Aplicação em PHP

Olá pessoal do iMasters Forum

Meu nome é Paulo, não costumo postar muito aqui no forum, mas me recorro a ele sempre que preciso de ajuda nas mais diversas áreas.

E agora, venho pedir vossa ajuda.

Estou no último período do curso de Sistemas de Informação. Eu sei programar em PHP, mas o máximo que já fiz foi o básico, um blog....

Nunca desenvolvi nenhuma aplicação completa. E agora estou precisando de ajuda para o seguinte: terei que desenvolver dois sistemas para a faculdade,

projetos meus.

O primeiro é um repositório online de objetos de aprendizagem, esse acho que não terei tanta dificuldade.

O outro é um sistema para gerenciamento de TCCs e Relatórios de Estágio para o departamento da minha universidade.

Aqui entra minha duvida:

já vi algumas aplicações prontas, e fico perdido em meio a tantas pastas config, include, templates, languages... smarty (nunca usei...)

Alguém conhece algum livro bom que eu possa utilizar para me auxiliar nesses desenvolvimentos, artigos, dicas, sugestões, msn para auxílio (>.<)

quem quiser me contactar, pode mandar um email: paulodemoc@live.com ou me adicionar no MSN

Aguardo resposta.

Obrigado pela atenção.

Paulo Henrique :)