Colocar variável em javascript dentro do php

Como eu faço para colocar uma variavel em javascript dentro do php, sendo q a função começa em javascript e depois ela fica em php como vou mostrar abaixo

<script language="javascript">

function inDeps()

{

var dep_id;

<?

 $db = mysql_pconnect($_SESSION['db_server'],$_SESSION['db_user'],$_SESSION['db_pass']);

 mysql_select_db($_SESSION['db_name'],$db);

 $query_dep= "delete from usudep where (usu_id = '".$id_usu_dep."')"?>

 

 frm=document.depto;

 for (i = 0; i < frm.length; i++)

 {

 if( frm*.checked )*

{

* dep_id = frm.name; ---------> preciso colocar essa variável***

<?

* $depid=**-------------------> Aqui** ?>alert(<?echo $depid;?>);<?*

* $db = mysql_pconnect($_SESSION['db_server'],$_SESSION['db_user'],$_SESSION['db_pass']);*

* mysql_select_db($_SESSION['db_name'],$db);*

* $query_ud = "select max(ud_id)+ 1 as id from usudep";*

$result_ud = mysql_query($query_ud,$db);

$dep = mysql_fetch_assoc($result_ud);

$dep_ud = $dep['id'];

$query_dep= "insert into usudep (ud_id, usu_id, dep_id) values ('".$dep_ud."','".$id_usu_dep."','".$depid."')";

$res_dep=mysql_query($query_dep,$db);

?>

}

}

window.close();

}

</script>