Compactar (Zipar) pastas no servidor

Ola, estou com um problema, sera que alguem pode me ajudar, tenho varios arquivos no meu servidor web que estao divididos em pastas, queria saber se tem algum jeito de zipar essas pastas com os arquivos dentro utilizando php ou se tem algum programa de ftp que tenha essa opcao de zipar, encontrei algumas funções de zipar em php aqui, mas era necessario digitar os nomes dos arquivos e sua extensao e isso fica inviavel pois demoraria mto..

se alguem tiver alguma solução agradeceria muito.