Criando instalador para sistema próprio

Olá,

tenho um sistema próprio feito em java e meu cliente possui Ubuntu, gostaria de criar um instalador para que faça tudo sozinho, sem eu precisar pegar a máquina e criar as pastas, baixar jdk, mover arquivos, por ae vai...

pesquisei sobre softwares que crie isto para mim, não tivi muito sucesso visando o linux,

agora penso em criar em shellScript, mas ae eu teria que enviar um diretório e pedir pro usuário dar permissão de execução em tal arquivo dentro do diretório para assim, começar o trabalho, achei um pouco complicado, dependendo do usuário.

Gostaria de opiniões e ajuda sobre este assunto que possa facilitar minha vida com o cliente/usuário.

Obrigado.