Problemas com funcao onload

Tente assim:

window.onload = function() {
 Custom.iniciar;
 Custom.iniciar1;
}

Há algum problema em ter duas linha com a função onload?

Sim, há problema.

A o evento onload recebe obrigatóriamente um único método.

Você atribui tal método ao evento onload.

Se atribuir outro método, valerá este último...

Solução?

Fazer como o mestre Maujor citou ou usar uma bliblioteca como jQuery, que aí você vai poder colocar quantas linhas quiser:

$(window).load(funcao1);
$(window).load(funcao2);

Mas caso você não queira usar o jQuery:

function addevent(obj, evento, funcao) {
	var resultado = false;
	if (window.addEventListener) {
 obj.addEventListener(evento, funcao, false);
 resultado = true;
	} else if (window.attachEvent) {
 resultado = obj.attachEvent('on' + evento, funcao);
	}
	return resultado;
}

para usar:

addevent(window, 'load', Custom.iniciar);
addevent(window, 'load', Custom1.iniciar1);

Caros amigos, obrigado pelas respostas, vou testar as opções citadas.

Agradeço a todos.