Executar Comando shell_exec()

Olá pessoal...

seguinte.. preciso de uma shell que consiga executar o seguinte comando:

java -jar GerarPDF.jar 1

mas este arquivo esta dentro de uma pasta

ja tentei um monte de coisa mas nao consigo executar.... se eu entrar no dos e for onde esta o arquivo e rodar o comando ele funciona, mas nao consigo rodar ele na minha aplicação php

alguém pode me ajudar?????? :D