Como manipular Janela Pai da Janela Pai?

Olá pessoal!

Fiz um sistema em php com alguns recursos em javascript, entretanto me deparei com um problema. O sistema basicamente funciona em duas janelas. Uma janela que é a principal e contém um botão, vamos chamá-la de Janela Principal, que abre uma janela secundária. Esta segunda janela é popup e possui outros botões, que chamaremos de Janela Secundária. Até aí tudo bem, pois eu utilizei window.opener.location.reload(); para atualizar sempre que for apertado um botão no Janela Secundária. Entratando, existem alguns botões nesta Janela Secundária que carregam uma nova página na mesma janela e esta nova página possui botões que também deveriam atualizar a Janela Principal, mas como o window.opener.location passou a ser a própria janela, ele não realiza tal operação. O que devo fazer?