Erro ao acessar pastas em url amigáveis

Tenho um site no qual utilizo o seguinte arquivo .htaccess para urls amigáveis

RewriteEngine On
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.*)$ index.php?isw=$1

E o seguinte arquivo para controlar o acesso as páginas:

	$atual = (isset($_GET['isw'])) ? $_GET['isw'] : 'principal';
	$pasta = 'paginas';
	if(substr_count($atual, '/') > 0){
 $atual = explode('/', $atual);
 $pagina = (file_exists("{$pasta}/".$atual[0].'.php')) ? $atual [0] : 'erro';
 $id = $atual[1];
 $busca = @$atual[2];
	}else{
	$pagina = (file_exists("{$pasta}/".$atual.'.php')) ? $atual : 'erro';
	$id = 0;
	}

Porém, preciso acessar uma pasta em especial, onde está o CMS do site. Quando tendo acessar (www.site.com.br/admin) ele vai para a página de erro. Tentei resolver criando um subdominio, porém, deu erro 500 ao acessar...

Existe alguma configuração no htaccess que resolva esse problema?