Problema com doctrine ao gerar entidades

Bom pessoal,

Por necessidade de desenvolvimento mais ágil adotei o codeigniter a um tempo atrás e peguei um bom domínio no framework. Recentemente senti a necessidade do uso de um framework para trabalhar com o banco de dados, já que estava trabalhando com bancos mais complexos. Adotei o doctrine por ser um framework com uma boa documentação, atualização e bem útil em relação a mapeamento de dados.

Para a integração dos frameworks eu utilizei este tutorial.

Bom, tenho um problema ao gerar automaticamente as entidades após fazer o mapeamento do banco de dados.

Segui a risca as configurações do tutorial, somente ignorando a criação do banco de dados via terminal pois meu banco já existia.

Então o que fiz foi executar o seguinte código:

orm:convert-mapping --from-database annotation models/Entity
Esse código criou as classes certinhas conforme o esperado. Mas somente declarando as variáveis privadas e um método construtor em classes com entidades com relacionamento.

Porém ao executar o código para gerar o getters e setters

orm:generate-entities --generate-annotations="true" models/Entity
Ele me retornou um erro:

No Metadata Classes to Proccess

Bom, criando os getters e setters na mão a integração funcionou perfeitamente. Meu único problema é ter que fazer isso na mão sempre que for mapear um banco. Imagine um banco com 50 tabelas com cada uma em média de 5~10 atributos.

Bom vou colar um código que foi gerado com sucesso no mapeamento do banco de dados.

<?php

use Doctrine\ORM\Mapping as ORM;

/**
* Usuarios
*
* @ORM\Table(name="usuarios")
* @ORM\Entity
*/
class Usuarios
{
/**
* @var integer $usuarioId
*
* @ORM\Column(name="usuario_id", type="integer", nullable=false)
* @ORM\Id
* @ORM\GeneratedValue(strategy="SEQUENCE")
* @ORM\SequenceGenerator(sequenceName="usuarios_usuario_id_seq", allocationSize="1", initialValue="1")
*/

 private $usuarioId;

 /**
 * @var string $usuarioNome
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_nome", type="string", length=32, nullable=false)
 */
 private $usuarioNome;

 /**
 * @var string $usuarioSobrenome
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_sobrenome", type="string", length=64, nullable=false)
 */
 private $usuarioSobrenome;

 /**
 * @var integer $usuarioCpf
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_cpf", type="integer", nullable=false)
 */
 private $usuarioCpf;

 /**
 * @var string $usuarioEmail
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_email", type="string", length=128, nullable=false)
 */
 private $usuarioEmail;

 /**
 * @var string $usuarioSenha
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_senha", type="string", length=128, nullable=false)
 */
 private $usuarioSenha;

 /**
 * @var string $usuarioNmMae
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_nm_mae", type="string", length=128, nullable=false)
 */
 private $usuarioNmMae;

 /**
 * @var integer $usuarioRg
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_rg", type="integer", nullable=false)
 */
 private $usuarioRg;

 /**
 * @var string $usuarioRgUf
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_rg_uf", type="string", nullable=false)
 */
 private $usuarioRgUf;

 /**
 * @var integer $usuarioRgOrg
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_rg_org", type="integer", nullable=false)
 */
 private $usuarioRgOrg;

 /**
 * @var date $usuarioRgDt
 *
 * @ORM\Column(name="usuario_rg_dt", type="date", nullable=false)
 */
 private $usuarioRgDt;

 /**
 * @var \Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection
 *
 * @ORM\ManyToMany(targetEntity="Telefones", inversedBy="usuario")
 * @ORM\JoinTable(name="usuario_telefone",
 * joinColumns={
 * @ORM\JoinColumn(name="usuario_id", referencedColumnName="usuario_id")
 * },
 * inverseJoinColumns={
 * @ORM\JoinColumn(name="telefone_id", referencedColumnName="telefone_id")
 * }
 * )
 */
 private $telefone;

 /**
 * @var \Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection
 *
 * @ORM\ManyToMany(targetEntity="Enderecos", inversedBy="usuario")
 * @ORM\JoinTable(name="usuario_endereco",
 * joinColumns={
 * @ORM\JoinColumn(name="usuario_id", referencedColumnName="usuario_id")
 * },
 * inverseJoinColumns={
 * @ORM\JoinColumn(name="endereco_id", referencedColumnName="endereco_id")
 * }
 * )
 */
 private $endereco;

 /**
 * @var \Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection
 *
 * @ORM\ManyToMany(targetEntity="ModalidadeJogo", inversedBy="usuario")
 * @ORM\JoinTable(name="usuario_modalidade",
 * joinColumns={
 * @ORM\JoinColumn(name="usuario_id", referencedColumnName="usuario_id")
 * },
 * inverseJoinColumns={
 * @ORM\JoinColumn(name="modalidade_id", referencedColumnName="modalidade_id")
 * }
 * )
 */
 private $modalidade;

 /**
 * @var EstadoCivil
 *
 * @ORM\ManyToOne(targetEntity="EstadoCivil")
 * @ORM\JoinColumns({
 * @ORM\JoinColumn(name="usuario_estado_civil", referencedColumnName="estado_civil_id")
 * })
 */
 private $usuarioEstadoCivil;

 public function __construct()
 {
 $this->telefone = new \Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection();
 $this->endereco = new \Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection();
 $this->modalidade = new \Doctrine\Common\Collections\ArrayCollection();
 }

Já procurei em diversos fóruns, mas não achei nenhuma solução (inclusive teve um sujeito que postou em diversos fóruns esta mesma dúvida a uns meses atrás mas em nenhum deles existiu uma resposta).

Agradeço desde já a ajuda pessoal.