Query com Registo de Duas Linhas Especificas

Boas Pessoal,

Tenho uma duvida no que trata a uma consulta em MYSQL que tem 2 campos, penso que tenho que fazer com sub-consultas mas não estou a conseguir, dai pedir a vossa ajuda.
Esta é a minha tabela onde quero sacar os dados, http://prntscr.com/217288.
O que quero é a diferença de tempo entre a entrada do Colaborador e a saída do Colaborador, cada registo é um evento de E=entrada e S=saída.
De referir que apenas conta o Colaborador Joao Martins, o que está em branco é apenas devido a confidencialidade dos dados, podem esquecer..
Para isso tentei algo do género:

SELECT timediff('hora_saida', 'hora_entrada') as Total from transacoes_bmw where rfid=123456789 and linha=126 and evento='E' and evento='S' and data=timestamp(current_date());

Mas não consigo saber através desta minha query de onde vem o hora_entrada, se do evento de E ou S.
Penso que o problema se resolve com sub-consultas para encontrar o registo de cada uma, mas não estou a ver como fazer...
Alguém me ajuda?