Caminhos no PHP sempre relativos ao root

Galera, bom dia. primeiramente obrigado por se interessarem no meu tópico.

Bom vamos lá, minha dúvida é simples e acredito que bastante gente tenha essa dúvida.

Como eu faço para padronizar os caminhos do meu PHP sempre relativos ao ROOT?

Eu gostaria de saber como trabalhar com diretórios, pois as vezes a aplicação contém várias pastas, e dependendo da saída do script ele me leva à uma pasta errada ou a um diretório que não existe.

Já li sobre __DIR__ mas não entendi muito bem como posso utilizar isso ao meu favor.

Obrigado pelas informações galera!

Abraços