Problema com upload de pdf em php

Boa tarde pessoal,

Estou com um problema para subir arquivos com extensão pdf, não são todos que não consigo enviar pro servidor, não sei o que fazer pois não havia acontecido isso antes comigo, vejam se podem me ajudar

Tenho o código

<?php
if (isset($_POST['manual'])) {
 $manual = $_FILES['img'];
 $produto = $_POST['produto'];
 $folder = '../../manuais/';
 $permite = array('application/pdf');
 $maxSize = 1024 * 1024 * 5;
 if (!empty($manual["name"])) {
 if (!in_array($manual['type'], $permite)) {
 echo "Somente arquivos com extensão PDF são permitidos.";
 } else
 if ($manual['size'] > $maxSize) {
 echo "Somente arquivos com extensão PDF menores que 5 Mb.";
 }

 $extensao = @end(explode('.', $manual["name"]));
 $novoNome = rand() . ".$extensao";

 if (move_uploaded_file($manual['tmp_name'], $folder . $novoNome)) {
 entrar();
 $SQL = "INSERT INTO manual (produto, manual) VALUES ($produto, '$novoNome')";
 if (mysql_query($SQL)) {
 echo "<script type='text/javascript'>
 alert('Manual cadastrado com sucesso!')
 location.href='listar.php';
 </script>";
 } else {
 echo 'Ocorreu um erro, manual não pode ser salvo. Entre em contato com o administrador.'; //mysql_error();
 sair();
 }
 } else {
 echo 'Ocorreu um erro, manual não pode ser movido. Entre em contato com o administrador.';
 sair();
 }
 } else {
 echo "vazio";
 }
}

Quando ocorre o problema recebo a seguinte mensagem com o comando "print_r($manual);"

Array ( [name] => 1351016251.pdf [type] => [tmp_name] => [error] => 1 => 0 )

e quando NÃO ocorre o problema fica da seguinte forma

Array ( [name] => amostra.pdf [type] => application/pdf [tmp_name] => /tmp/phpu67lam [error] => 0 => 109495 )

Agradecido!