UPDATE Mysql problema!

Olá, preciso realizar um comando no SQL do meu banco de dados.

Tenho diversos números em uma determinado coluna para todos os registros como por exemplo:

ID | NOTA

1 -25141005

2 -441811410

Preciso realizar o update dos registros da coluna NOTA, más existe um porém, são mais de 5 mil registros, e necessito contar a string que está na coluna SQL e após 3 digitos, preciso inserir um ".".

Por exemplo:

ID | NOTA

1 -25.141005

2 -44.1811410

Algéum se identifica com este problema?