Como usar corretamente o codeIgniter com Bootstrap

Caros amigos, estou iniciando estudos com o codeigniter e bootstrap, e tenho uma dúvida muito primária.

Minha dúvida é a seguinte: Para criação e validação de formulários é necessário que eu use o Helper 'form' do CodeIgniter, ou posso fazer direto pelo Bootstrap.

Ou seja criar os inputs tudo pelo CodeIgniter com as classes do bootstrap, ou realizar a criação direto pelo Boostrap que particularmente acho mais fácil.

Gostaria de saber se alguém tem alguma dica de melhores práticas para utilizar os dois juntos.

Desde já agradeço