Problemas com configuração do Terminal Service

Bom dia amigos.Pessoal gostaria da ajuda vcs para solucionar um problemas que tendo.Possuo um software de controle de processos de fabricação instalado em um equipamento que possui o SO Windows 2000 Advanced Server.Eu gostaria que esse aplicativo fosse acessado via terminal service, porém estou tendo problemas para implementar esta solução.Quando eu abro o terminal service maneger eu visualizo na aba de processos todos os executaveis referentes a esse sistema rodando em modo console. Quando acesso esse sistema em um outro equipamento com terminal service alguns .exe deste sistema não funcionam pois ele entendo que o processo já esta sendo executado em modo concole e não consegue inicializar esses .exe em modo remoto. Existe alguma maneira dos clientes inicializarem sua sessão com as mesma configurações e serviços do modo console?Abraços e aguardo um retorno o quanto antes.