Caixa de texto com pergunta ao usuario em javascript se sim executar c

Estou com problemas preciso executar um código PHP dentro de um javascript,no código é para aparecer uma caixa de texto com a opção sim e não isso em javascriptse o usuário escolher sim executa o código em php se escolher não continua na mesma páginaDesde já agradeço a ajuda de vocês bom trabalho a todos!Carlos Adriano