Configurar o limite de conexão

E ae pessoalEu estou com um problema de conexão no mysql que é o seguinte, o mysql esta funcionando legal e eu tenho o apache conectando no mysql com php que também esta funcionando normal, aí eu precisei instalar o tomcat para usar jsp e fiz o código de conexão que estas ok porém ele da uma mensagem de conexão negada, aí procurei na net e descobri que eu tenho que aumentar o limite de conexão. Como eu faço isso ? estou usando linuxAbrigado