ecapar caracteres de formatação

Oi galera beleza,estou precisando aplicar replace(".","/","-") para a seguninte comparação ficar true.mas num sei como aplicá-la.

if (isNaN(d.cnpj.value)){ alert ("O campo " + d.cnpj.name + " deve conter apenas numeros!"); d.cnpj.focus(); return false; }

desde já paulo costa