Condicionais css com programação

Senhores, bom dia!

Minha dúvida é a seguinte, diante de tanta discussão sobre hacks ou não para alguns navegadores, de condicionais ou não para os mesmos, optei por utilizar a ultima opção para a construção de páginas XHTML, mas estou com um problema.

Ao construir as páginas XHTML (puro) as condicionais funcionam perfeitamente, cada um no seu quadrado (piadinha sem graça http://forum.imasters.com.br/public/style_emoticons/default/blush.gif ), mas quando começo a trabalhar com tags JSF (Java server faces) para a construção do sistema, o que ocorre é que o css do IE, sobreescreve o css "normal". Parece que o css a ser executado pelo Firefox no caso é sobrescritoo pelo css do IE, que por sua vez se localiza dentro de um comentário condicional. O que pode estar ocorrendo, alguem ja teve algum problema semelhante?

Segue a condicional:

<link href="caixaDeServico.css" rel="stylesheet" media="all" type="text/css" />
<!--[if gte IE 6]>
<link href="caixaDeServicoIe.css" type="text/css" rel="stylesheet" />
<![endif]-->