Out of Memory em exportação de Dados

Estou tendo um problema aqui em uma aplicação que desenvolvi que na hora em que eu coloco para fazer a transferência de uma base de dados local para uma base de dados remota fazendo as devidas modificações nos campos que necessitam de tal alteração, ele da erro de Falta de Memória (Out of Memory) quando está por volta dos 80%

Servidor Local: Windows XP SP3

Servidor Remoto: Linux Red Hat AS 5

Mysql 5.0.67

A minha máquina tem 2GB de memória, processador Intel Core2Duo E4500@2.20GHz (2MB de Cache L2), blá blá blá.