Isapi Rewrite

Boa tarde pessoal.

Estou precisando de uma força pra fazer o seguinte:

Eu possuo um site adicional na minha hospedagem, que esta na pasta /fundacao

Gostaria de editar o .htaccess pra trabalhar somente nesse site adicional (somente retirando o .php das páginas inicialmente), só que preciso colocar o .htaccess na pasta raiz.

No momento tenho isso:

RewriteEngine On
RewriteBase /fundacao
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.*)$ $1\.php

Só que funciona somente assim: www.siteprincipal.com.br/fundacao/pagina

Se eu for direto no dominio, exemplo: www.siteADICIONAL.com.br/pagina não funciona. Alguem poderia me dar uma força?

Outra coisa, pra redirecionar páginas de erro desse site adicional como ficaria a regra?

Obrigado!