Como modelar a área dos JS de seu site ou sistema

E aew galera, beleza?

Olha só, gostaria de ver com vocês qual a melhor maneira que vocês consideram para organizar os javascripts de seus sites.

Eu atualmente estou usando mais ou menos assim:

Estou criando um arquivo para cada nova função, e apenas dentro da página que vou usar que o chamo.

As pastas estão assim:

• adds -> pastas com os apis que uso, tipo, calendario, prettyphoto, maskedinput, estas coisas
• funcoes -> aqui vao todas as funcoes, onde cada uma delas fica em um arquivo separado para que eu possa chamá-la apenas quando necessitar
• incs -> são includes de grupos de funcoes, ex: tenho a listagem_completa onde tenho as funcoes(marca_linha, seleciona_linha, marca_todos, exclui_linha) e a listagem_resumida(chamo apenas a função marca_linha)

O que vocês acham desta organização.

Tem novas sugestões ou dica para passar?

Abraços!