Quando usar MyISAM ou InnoDB?

Olá pessoal, sou iniciante e tenho duas dúvidas:

1 - Gostaria que alguém explicasse (se possível) a diferença entre ENGINE=MyISAM e ENGINE=InnoDB e o ganho/perda de performance ao usar um ou o outro.

2 - Se eu uso id int(4) NOT NULL auto_increment, em uma tabela, isso significa que quando o "id" chegar ao número 9999 ele irá parar de gravar os valores?