Boleto PHP ( $taxa )

Boa tarde galera.

Eu tenho algumas dúvidas, com relação a algumas taxas. No boletophp o opensource gerador, ele possui uma variável $taxa, no caso essa taxa será somada ao valor final do boleto?

Eu estou fazendo essa pergunta porque eu gostaria de saber se mesmo gerando o boletophp através do sistema, o banco irá cobrar a taxa dele em cima do serviço? Independente de qual sistema você gere o boleto?

Alguém já passou por uma experiência parecida?