Diferenças na resolução original do "design responsive"

Pessoal, bom dia!

Seguinte, estou desenvolvendo o meu primeiro site com design responsive e estou com problemas com medidas (rsrsrs)... Fiz o HTML e o CSS com "%" e "em" embasado em um layout do photoshop de 1350px em um monitor com resolução de 1600px. Quando comecei a implementar as media querie, notei que se colocar a tela em 1350px (Plugin do Chrome, Resize Window), já quebra os elementos. Como posso solucionar esse caso?