Checkbox Marcar/Desmarcar todos

Tenho uma pagina chamado intervalo.php, nela tenho essa função Javascript:

<script language="javascript" type="text/javascript">

 function marcardesmarcar(){
 $('.marcar').each(
 function(){
 if ($(this).prop( "checked"))
 $(this).prop("checked", false);
 else $(this).prop("checked", true);
 }
 );
 }

</script>

Logo abaixo tenho o php e no meu código Php tenho um checkbox para marcar/desmarcar todos:

echo "<td>";

 echo "<span id='checar'>Marcar todos</span><input type=checkbox name='MarcaTodos' onClick='marcardesmarcar();'/>";

echo "</td>";

Depois dentro de um While tenho a linha que mostra o checkbox que teria q ser marcado ou desmarcado de acordo com o de cima, o While funciona correto, o problema é que quando eu seleciono o marcar todos ele não marcar nos demais, abaixo o código do que deveria ficar selecionado:

echo "<input type='checkbox'";

Pq ele não Marca ou desmarca conforme solicitado??