Contador de Visitas

No meu site uso os códigos do  Bootstrap em alguns itens.  Quero tirar uma dúvida.

A chamada de código javascript e css do Bootstrap anula os comandos do código PHP?

Eu notei que quando eu chamo o Bootstrap dentro do head o código php não funciona.

Tenho um código PHP de contador de visitantes.

Ele sozinho funciona.  Ele junto com o Bootstrap ele não funciona.

Tem algum modo de fazer o código PHP funcionar junto com o Bootstrap?

Boa noite

<? php

$arquivo = "contadorvisitas.txt";
$contador = (integer)0;
$fp = fopen($arquivo,"r");
$contador = fgets($fp, 26);
fclose($fp);
++$contador;
$fp = fopen($arquivo,"w+");
fwrite($fp, $contador, 26);
fclose($fp);
echo "Esta página foi visitada $contador vezes";
?>

	 

 <!-- BOOTSTRAP -->
 <meta name="viewport" content="width=device-width, initial-scale=1"> <!-- uso com Bootstrap para Mobile -->
 <link rel="stylesheet" href="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.7/css/bootstrap.min.css"
 integrity="sha384-BVYiiSIFeK1dGmJRAkycuHAHRg32OmUcww7on3RYdg4Va+PmSTsz/K68vbdEjh4u" crossorigin="anonymous">
 <link rel="stylesheet" href="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.7/css/bootstrap-theme.min.css"
 integrity="sha384-rHyoN1iRsVXV4nD0JutlnGaslCJuC7uwjduW9SVrLvRYooPp2bWYgmgJQIXwl/Sp" crossorigin="anonymous">
 <script src="https://maxcdn.bootstrapcdn.com/bootstrap/3.3.7/js/bootstrap.min.js"
 integrity="sha384-Tc5IQib027qvyjSMfHjOMaLkfuWVxZxUPnCJA7l2mCWNIpG9mGCD8wGNIcPD7Txa" crossorigin="anonymous"></script>