Recuperação extrema de arquivos corrompidos no HD

Bom dia pessoal

Estou passando por um problema um tanto grave, eu tenho um hd que contem arquivos muito importantes, como planilhas de comercialização,notas fiscais etc e ele na primeira vez que o abri ele apareceu sem nenhum arquivo dentro, tudo oculto ou corrompido

Frente a isso eu passei o software HDD Regenarator para ver se existiam bad blocks mas nenhum foi localizado, frente a isso eu passei o programa mini tool power recovery para scanear estes arquivos e recupera-los, ele achou a arvore de arquivos só que eu criei uma pasta dentro do mesmo HD para salvar os arquivos recuperados, quando foram salvos vieram todos corrompidos, com isso tenho riscos de ter sido corrompidos os arquivos raizes? Pois agora na minha cabeça está passando que pela primeira tentativa de recovery mesmo em pastas diferentes ele tenha salvado os arquivos corrompidos por cima dos arquivos raizes, e esse é meu medo, essa informação pode proceder?

Desde já agradeço e um bom dia a todos!