Eu queria agradeçer a respostas de todos aqui que me ajudaram, fico feliz por ter tantas pessoas boas no mundo, mas eu consegui resolver meu problema, foi até facil.
var cor = "Black";
setInterval(()=>{
if(cor == "Black"){
//executa o codigo necessario
cor = "White";
else{
//executa o codigo necessario
cor = "Black";
}
}, 5000);