Eu queria agradeçer a respostas de todos aqui que me ajudaram, fico feliz por ter tantas pessoas boas no mundo, mas eu consegui resolver meu problema, foi até facil.
 
	 
 
var cor = "Black";
setInterval(()=>{
	if(cor == "Black"){
    	//executa o codigo necessario
      	cor = "White";
   	else{
      	//executa o codigo necessario
      	cor = "Black";
    }
}, 5000);