javascript Evento de manipulação em checkbox com javascript

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Galera, seguinte. Estou tentando criar um evento em javascript que funciona da seguinte maneira; existem 5 checkbox na tela, ao selecionar dois checkbox os outros irão travar e não permitir o clique, se o usuário clicar novamente retirando a seleção de algum dos que foi selecionado ele volta a habilitar. Até então o código funciona blz, porém agora eu preciso fazer com que os dois primeiros checkbox contém como um único clique, ou seja, são 2 checkbox para travar, porém se eu selecionar o primeiro e o segundo eles contam como um, então eu o usuário poderia realizar outro clique em algum checkbox e ficariam 3 checkbox selecionados, porém isso só se aplica aos dois primeiros checkbox, caso não sejam eles é apenas dois cliques, se eles forem clicados o usuário pode escolher mais uma opção.

 

o código atual está assim:

 

<script type="text/javascript">
            (function(){
                "use strict";
                var marcados = 0;
                var verifyCheckeds = function($checks) {
                    if( marcados>=2 ) {
                        loop($checks, function($element) {
                            $element.disabled = $element.checked ? '' : 'disabled';
                        });
                    } else {
                        loop($checks, function($element) {
                            $element.disabled = '';
                        });
                    }
                };
                var loop = function($elements, cb) {
                    var max = $elements.length;
                    while(max--) {
                        cb($elements[max]);
                    }
                }
                var count = function($element) {
                    return $element.checked ? marcados + 1 : marcados - 1;
                }
                window.onload = function(){
                    var $checks = document.querySelectorAll('input[type="checkbox"][name="modalidades[]"]');
                    loop($checks, function($element) {
                        $element.onclick = function(){
                            marcados = count(this);
                            verifyCheckeds($checks);
                        }
                        if($element.checked) marcados = marcados + 1;
                    });
                    verifyCheckeds($checks);
                }
            }());
        </script>

 

 

Quem conseguir me ajudar eu agradeço, preciso muito desse código rodando.